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1、预处理：屠宰废水的预处理是整个系统能否有效运行的关键。屠宰废水中固体悬浮物高达600-700mg/L，该类悬浮物属易腐化的有机物，必须在进入处理系统前加以拦截，以防止后续管道、设备的堵塞，延长设备的使用寿命，同时可避免悬浮固体有机质腐化成为溶解性有机质，导致废水CODcr、BOD5浓度升高。
2、厌氧部分：屠宰废水中的有机物主要为蛋白质和脂肪，难以被一般的好氧菌直接利用，其生物降解过程中一般是先通过酶的作用分解成氨基酸、碳水化合物等小分子有机物，然后方可被好氧菌直接利用。废水的污染物浓度较高，直接用好氧工艺去除全部的有机物将消耗大量的电能，势必增加系统的运行费用。
3、好氧部分：SBR工艺是一种间歇式的活性污泥系统，其基本特征是在同一反应池内的不同时段实现不同有机物的去除。单个SBR池运行包括进水、反应、沉淀、出水和闲置5个基本工序，周而复始的循环运行。该工艺不需另设二沉池和污泥回流设备，工艺流程简单、处理效果良好。
4、消毒处理。
为了节省运行成本，选择一种既要处理效果好，又要节省运行成本的屠宰污水处理设备工艺是非常重要的。